Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd3Q91W18 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd3Q91W18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd3Q91W18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd3Q91W18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd3Q91W18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd3Q91W18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd3Q91W18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd3Q91W18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms