Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Itgbl1Q8VDV0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Itgbl1Q8VDV0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Itgbl1Q8VDV0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Itgbl1Q8VDV0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Itgbl1Q8VDV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Itgbl1Q8VDV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Itgbl1Q8VDV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,6 ms