Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SnrkQ8VDU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SnrkQ8VDU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SnrkQ8VDU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SnrkQ8VDU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SnrkQ8VDU5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms