Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn4Q8VCH8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubxn4Q8VCH8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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