Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4H2

Arhgef12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef12Q8R4H2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Arhgef12Q8R4H2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Arhgef12Q8R4H2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Arhgef12Q8R4H2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Arhgef12Q8R4H2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34,26■■■■□ 3,08
Arhgef12Q8R4H2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34,23■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34,2■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Arhgef12Q8R4H2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34,2■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Arhgef12Q8R4H2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
Arhgef12Q8R4H2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Arhgef12Q8R4H2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,5 ms