Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gle1Q8R322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gle1Q8R322 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gle1Q8R322 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms