Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf3c5Q8R2T8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gtf3c5Q8R2T8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c5Q8R2T8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms