Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PolbQ8K409 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PolbQ8K409 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PolbQ8K409 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms