Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nsl1Q8K305 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nsl1Q8K305 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nsl1Q8K305 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nsl1Q8K305 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms