Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk17Q8K0D0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk17Q8K0D0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk17Q8K0D0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms