Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SbsnQ8CIT9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SbsnQ8CIT9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms