Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc73Q8CDM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms