Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCP0

Nemf, Nuclear export mediator factor Nemf, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NemfQ8CCP0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NemfQ8CCP0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NemfQ8CCP0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NemfQ8CCP0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NemfQ8CCP0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NemfQ8CCP0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NemfQ8CCP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms