Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf31Q8CCF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prpf31Q8CCF0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf31Q8CCF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms