Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CntrobQ8CB62 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntrobQ8CB62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CntrobQ8CB62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms