Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppfibp1Q8C8U0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppfibp1Q8C8U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfibp1Q8C8U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfibp1Q8C8U0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms