Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4bQ8C6J9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4bQ8C6J9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4bQ8C6J9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4bQ8C6J9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4bQ8C6J9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4bQ8C6J9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4bQ8C6J9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms