Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8C5C9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8C5C9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8C5C9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8C5C9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8C5C9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8C5C9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8C5C9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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