Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim47Q8C0E3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim47Q8C0E3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim47Q8C0E3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms