Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trerf1Q8BXJ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trerf1Q8BXJ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trerf1Q8BXJ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trerf1Q8BXJ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms