Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Slx1bQ8BX32 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Slx1bQ8BX32 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slx1bQ8BX32 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx1bQ8BX32 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms