Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm4aQ8BW72 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kdm4aQ8BW72 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm4aQ8BW72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm4aQ8BW72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms