Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pggt1bQ8BUY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pggt1bQ8BUY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pggt1bQ8BUY9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pggt1bQ8BUY9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms