Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sp8Q8BMJ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sp8Q8BMJ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sp8Q8BMJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sp8Q8BMJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sp8Q8BMJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sp8Q8BMJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sp8Q8BMJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sp8Q8BMJ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms