Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ7

Cgrrf1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cgrrf1Q8BMJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cgrrf1Q8BMJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cgrrf1Q8BMJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cgrrf1Q8BMJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms