Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hirip3Q8BLH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hirip3Q8BLH7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hirip3Q8BLH7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hirip3Q8BLH7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms