Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIH0

Sap130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap130Q8BIH0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sap130Q8BIH0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sap130Q8BIH0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sap130Q8BIH0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sap130Q8BIH0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sap130Q8BIH0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sap130Q8BIH0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sap130Q8BIH0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sap130Q8BIH0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms