Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NfascQ810U3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfascQ810U3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfascQ810U3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms