Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cracr2bQ80ZJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cracr2bQ80ZJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cracr2bQ80ZJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms