Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Crb2Q80YA8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Crb2Q80YA8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crb2Q80YA8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crb2Q80YA8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms