Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcsk9Q80W65 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcsk9Q80W65 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcsk9Q80W65 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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