Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AknaQ80VW7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
AknaQ80VW7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
AknaQ80VW7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
AknaQ80VW7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
AknaQ80VW7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms