Protein–RNA interactions for Protein: Q80V94

Ap4e1, AP-4 complex subunit epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4e1Q80V94 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap4e1Q80V94 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ap4e1Q80V94 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap4e1Q80V94 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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