Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sdccag8Q80UF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sdccag8Q80UF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sdccag8Q80UF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sdccag8Q80UF4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms