Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Avl9Q80U56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Avl9Q80U56 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Avl9Q80U56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms