Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctdp1Q7TSG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctdp1Q7TSG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctdp1Q7TSG2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctdp1Q7TSG2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms