Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nek5Q7TSC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek5Q7TSC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek5Q7TSC3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek5Q7TSC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek5Q7TSC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek5Q7TSC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek5Q7TSC3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms