Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ScocQ78YZ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ScocQ78YZ6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ScocQ78YZ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ScocQ78YZ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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