Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim12Q78RX3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim12Q78RX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim12Q78RX3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim12Q78RX3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms