Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sned1Q70E20 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sned1Q70E20 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sned1Q70E20 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sned1Q70E20 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms