Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpv1Q704Y3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpv1Q704Y3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trpv1Q704Y3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpv1Q704Y3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms