Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smpd4Q6ZPR5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smpd4Q6ZPR5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smpd4Q6ZPR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms