Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ube2oQ6ZPJ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube2oQ6ZPJ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube2oQ6ZPJ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms