Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c54Q6XVG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c54Q6XVG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp2c54Q6XVG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp2c54Q6XVG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms