Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54bQ6PFE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rad54bQ6PFE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad54bQ6PFE3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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