Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtifQ6PEE2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtifQ6PEE2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtifQ6PEE2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtifQ6PEE2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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