Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim37Q6PCX9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim37Q6PCX9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim37Q6PCX9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim37Q6PCX9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms