Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppp4r3aQ6P2K6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppp4r3aQ6P2K6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppp4r3aQ6P2K6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppp4r3aQ6P2K6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms