Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt39Q6IFX4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt39Q6IFX4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt39Q6IFX4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt39Q6IFX4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms