Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Surf4Q64310 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Surf4Q64310 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Surf4Q64310 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms